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利用Trizol法提取植物乳桿菌總RNA

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點擊量: 160274 來源: 江陰得雷國際貿(mào)易有限公司
一、實驗原理
Trizol的主要成分是苯酚,苯酚的主要作用是裂解細胞,使細胞中的核酸物質(zhì)得到釋放。同時苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。 0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強抑制作用。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。利用Trizol試劑處理的樣品加入氯仿后,經(jīng)離心樣品分成水樣層、中間層和有機層。RNA存在于水樣層中,收集水樣層后可以通過異丙醇沉淀RNA。
 
二、實驗試劑
Trizol試劑,DEPC,氯仿,異丙醇,DEPC處理水,75%的乙醇(DEPC水配制),植物乳桿菌05-19
三、實驗儀器
恒溫培養(yǎng)箱,常溫離心機,低溫離心機,移液器,電泳儀,電泳槽,紫外分析儀
四、操作步驟
接植物乳桿菌于MRS液體培養(yǎng)基中,于37℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜備用。
取菌液2ml,12000rpm離心2分鐘,棄上清,加入1ml Trizol試劑,用槍吹吸,懸浮菌體,室溫放置十分鐘。
加入200ul氯仿,蓋緊離心管,用手劇烈震蕩15秒,4℃12000rpm離心十分鐘。
取上清(大約500ul),加入等體積異丙醇,-20℃放置十分鐘,4℃12000rpm離心十分鐘。
棄去上清,加入1ml 75%乙醇,混勻,4℃12000rpm離心五分鐘。
小心棄去上清液,室溫干燥5-10min,注意不要過分干燥,否則會降低RNA的溶解度。然后將RNA溶解到15ul的DEPC處理水中。
進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,并將剩余RNA保存于-70℃。
實驗注意事項
整個操作要帶一次性口罩及手套,并盡可能低溫下操作。
加入氯仿后,首先混合均勻,吸取上清時,注意不要吸入中間層及有機相。
使用無RNase 的塑料制品和槍頭避免交叉污染
配制溶液應(yīng)使用無RNase 的水。